叶轮专用射芯机的清洗主体部分便是芯盒，想要清洗芯盒可以用压缩空气为动力，将喷枪内的磨液通过高速喷射来进行清洗芯盒。还可以通过磨液的循环流动从而达到对芯盒的清洗目的。

叶轮专用射芯机除了芯盒需要清洗之外，还需要对设备内部其他零件进行清洗。内部零件的清洗需要运用到专业的清洗剂，工作人员在选择清洗剂时也需要选择合适的产品来进行清洗工作。防止不合适的清洗剂本身对设备零部件造成伤害。

叶轮专用射芯机设备的表面清洁工作也是需要特别注意的。工作人员在日常的工作结束之后，可以对设备表面进行清洁，日常的清洗可以有效的防止设备表面出现积垢的现象，从而减少设备出现生锈的情况。